功能性阳痿是由神经系统的生理变化所致，主要表现为阴茎在性生活中无法勃起。而器质性阳痿则是由动脉供血不足、静脉泄漏以及神经和内分泌因素的影响所导致的。

过去的观点认为，功能性阳痿占总数的90%，而器质性阳痿只占10%。然而，随着现代医学检查技术的不断进步，功能性阳痿的比例大约在50%到70%之间，而器质性阳痿的比例则大约在30%到50%之间。

为了区分功能性阳痿和器质性阳痿，需要根据不同的治疗方法和治疗效果来进行区分。在紧急情况下，功能性阳痿的发病通常比器质性阳痿更为突然，进展也更快。此外，功能性阳痿的原因与精神因素有关，如恐惧、抑郁、焦虑、精神创伤、内疚、夫妻感情不和谐、缺乏性知识、过度自慰等；而器质性阳痿则主要与性器官解剖异常、创伤、药物中毒、某些慢性疾病等有关。从夜间到早晨醒来的阴茎勃起方面，功能性阳痿表现为阴茎勃起困难，而器质性阳痿则表现为无勃起或勃起不强。

在性刺激下，出现功能性阳痿时阴茎会勃起，但在试图进行性交时，勃起会消失。而器质性阳痿时，勃起会减弱或完全消失，对性刺激缺乏反应。进行阴茎海绵体血管活性物质注射试验时，功能性阳痿通常会在8-10分钟内完全勃起，而器质性阳痿（排除神经性阳痿）在8-10分钟内勃起的程度不会尽如人意。对于功能性阳痿，主要采用心理和药物治疗，预后较好。而对于器质性阳痿，主要采用器械和手术治疗，近期和长期疗效不尽如人意。